ADFTest Summary

Via implementaties van de ZIB Laboratoriumuitslag 4.0 (e-Lab / Lab2Lab / Lab2PublicHealth / Lab2Zorg) kwam ik op problemen in de terminologiekoppelingen (concept en waardelijst) binnen het Monster-deel.
Ik heb deze voorgelegd aan Feikje Hielkema, Nictiz SNOMED NRC en Pieter-Jan Haas, art-microbioloog NVMM en lijk dan bevestigd te worden in mijn vermoeden. Het betreft de concepten:

1. NL-CM:13.1.16 Monstermateriaal
2. NL-CM:13.1.26 AnatomischeLocatie
3. NL-CM:13.1.18 Afnameprocedure
4. NL-CM:13.1.28 Morfologie
5. NL-CM:13.1.29 BronMonster

Bijgaand het verslag uit de mailwisseling. Zou samen met Feikje/Terminologieteam gekeken kunnen worden naar mogelijkheden voor verbetering?
------
Van: Pieter-Jan Haas
Beste Alexander,
Het concept model zoals je dat met Feikje hebt gevonden is correct. De 2 in rood gemarkeerde mappings zijn dus fout. Snomed geeft overigens ook aan welke verzameling aan concepten geldig is per materiaal variable (zie snomed technical implementation guide)
voor 'specimen source identity' is dit bv.

Person	125676002 (<<)
Family	35359004 (<<)
Community	133928008 (<<)
Device	49062001 (<<)
Environment	276339004 (<<)

Dat staat ook niet goed in ZIB Lab 4.0
Pieter-Jan Haas{{
}}
{{{color:#800080}----- Forwarded by Jeroen Alblas/RIVM/NL on 18-12-2017 16:46 -----
}}
{{{color:#5f5f5f}From:        Alexander Henket <henket@nictiz.nl> }}
{{{color:#5f5f5f}To:        Jeroen Alblas <jeroen.alblas@rivm.nl>, }}
{{{color:#5f5f5f}Cc:        Annelies Kroneman <annelies.kroneman@rivm.nl>, Feikje Hielkema <hielkema@nictiz.nl>, Albert-Jan Spruyt <Spruyt@nictiz.nl> }}
{{{color:#5f5f5f}Date:        18-12-2017 15:46 }}
{{{color:#5f5f5f}Subject:        SNOMED CT assen voor aanvullende monstereigenschappen }}
{{}}

---

{{Jeroen, }}

{{Zoals net telefonisch besproken. Zowel Type-Ned als ISIS-AR willen graag, dezelfde, aanvullende eigenschappen bij een isolaat kunnen doorgegeven. ISIS-AR specificeert daarvoor velden in SPM en Type-Ned specificeert hiervoor OBX-segmenten na de SPM. Het zou goed zijn om tot 1 oplossing te komen. }}
{{Los daarvan is er een onduidelijkheid in de gevraagde informatie. Die spreidt zich uit over 5 assen met als omschrijving: substance, topo, proc, morph en ident. Op zoek naar de SNOMED CT concepten bij die assen, heb ik met Feikje Hielkema gezocht in de SNOMED CT Concept Model tak en ben tot onderstaande gekomen. Kun je deze met Pieter-Jan valideren? }}
{{    <valuecaption="substance">370133003^Specimen substance (attribute)^SNM</value> }}
{{    <valuecaption="topo"          >118169006^Specimen source topography (attribute)^SNM</value> }}
{{    <valuecaption="proc"          >118171006^Specimen procedure (attribute)^SNM</value> }}
{{    <valuecaption="morph"        >118168003^Specimen source morphology (attribute)^SNM</value> }}
{{    <valuecaption="ident"        >118170007^Specimen source identity (attribute)^SNM</value> }}
{{Merk op dat in sommige gevallen, dit zou kunnen betekenen dat de ZIB Lab 4.0 incorrecte koppelingen heeft. Dit is voor Pieter-Jan en Albert-Jan ook relevant, zie regels in rood: }}
{{{color:#3f803f}Substance = NL-CM:13.1.16 Monstermateriaal = 370133003 Specimen substanceTopo = NL-CM:13.1.26 AnatomischeLocatie = 405814001 Procedure site - IndirectProc = NL-CM:13.1.18 Afnameprocedure = 118171006 Specimen procedure
Morph = NL-CM:13.1.28 Morfologie = 118168003 Specimen source morphology }}
{{{color:#bf4100}Ident = NL-CM:13.1.29 BronMonster = 127454002 Device specimen }}
{{Alvast dank }}
{{    }}
{{Alexander Henket }}